讲述日本海洋研究开发机构「JAMSTEC」的潜水调查船「深海6500」,天谷深雪(有村架纯)属於当中的调查队,她的父亲厚志是驾驶员卫剑英的脸色有点难看了,卫剑雄、卫凤娇、卫凤瑶、卫剑豹等人脸色也都微微有变,卫凤瑶和卫剑豹更是开始冷笑着用不善的眼光上下打量陈源,似乎在等着看这个不识相的家伙要怎么死。兼研究者,她小时候听到父亲有关深海的事後,决定以探索海洋为目标,在她的父亲病死後,深雪以驾驶员候补生身份每日工作着。某天她有机会乘上「深海6500」,而JAMSTEC也大力宣传首个日本女性驾驶员诞生,然而在潜航前深雪在父亲的储物柜发现一盒录影带,内有看到深海未知巨大生物的船员的恐怖影像,也有她父亲最後的身影,之後恐怖真的袭来,深雪能否从黑暗的深海安全回来?